违反传染病防治法的规定，引起甲类或者按照甲类管理的传染病传播或者有传播严重危险，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：（一）供水单位供应的饮用水不符合国家规定的卫生标准的；（二）拒绝按照疾病预防控制机构提出的卫生要求，对传染病病原体污染的污水，污物，粪便进行消毒处理的；（三）准许或者纵容传染病病人，病原携带者和疑似传染病病人从事国务院卫生行政部门规定禁止从事的易使该传染病扩散的工作的；（四）拒绝执行疾病预防控制机构依照传染病防治法提出的预防，控制措施的。本条和本条规定的第50条规定的甲类感染病，是指鼠疫、霍乱的甲类管理的感染病，是指乙类感染病中的感染性非典型肺炎、炭蛆中的肺炭蛆、人类感染高致病性禽流感和国务院卫生行政部门根据需要通过国务院批准实施的其他需要甲类管理的乙类感染病和突发原因不明的感染病。

什么情况下会认为严重妨害传染病防治罪在犯罪的

如果有供水单位供应的饮用水不符合国家规定的卫生标准的或是拒绝按照疾病预防控制机构提出的卫生要求，对传染病病原体污染的污水、污物、粪便进行消毒处理等其他情况的，那么就会构成妨害传染病防治罪。犯本罪一般会被判处三年以下有期徒刑或拘役，如果造成后果特别严重的话，会被判处三至七年之间的有期徒刑。

《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）》第49条