电子往来港澳通行证为参照有关国际标准设计制作的卡式证件，内部嵌有非接触式集成电路芯片，存储持证人个人资料及证件、签注签发管理信息，采用成熟的数字安全防伪机制进行保护，印制过程中还使用了多项物理防伪技术，防伪能力明显增强。电子往来港澳通行证启用后，往来港澳签注不再采取贴纸的方式，而是直接打印在证件背面(可以重复擦写)。内地和港澳地区口岸查验部门查验时不再加盖验讫章，签注使用情况由计算机信息系统记录管理，有需要的持证人可向内地及港澳地区主管部门查询签注剩余次数等信息。

电子往来港澳通行证由“本”变“卡”

从外观上看，电子往来港澳通行证为参照有关国际标准设计制作的卡式证件，往来港澳签注也不再采取贴纸的方式，而是直接打印在证件背面，且可以重复擦写。

电子往来港澳通行证正面、背面分别印有线描写意手法的长城和紫荆花、莲*团，辅以传统祥云装饰纹，使用了双色套印、光变油墨、微缩印刷、纽索、劈线等十几项物理防伪技术。

电子往来港澳通行证申请申请人需留指纹

新证将对16周岁以上(含)的申请人采集或核验指纹，未满16周岁者可以不采集，如有经常往来港澳需求的，可以在监护人的要求下采集指纹。

此外，成人电子往来港澳通行证有效期延长为10年，对未满16周岁的仍签发5年有效通行证。

电子往来港澳通行证可用自助查验通道

内地口岸边检机关对7周岁以上(含)、已留存指纹信息的持证人，均允许经自助通道通行。但对于从同时通航港澳的空港、海港口岸出境的，暂时无法提供自助通关服务;赴港澳旅游团队仍需按现行规定经由人工检查通道出境。

电子往来港澳通行证首次入境香港需人工批准

根据香港入境事务处规定，16周岁以下人员不能使用香港自助查验通道(通常称为“e-道”)，16周岁以上(含)、持用新申领的电子往来港澳通行证首次入境香港，仍须经人工查验，才能在该次入境后使用香港自助查验通道。

电子往来港澳通行证签注使用可查询

内地公安机关出入境管理部门将向持证人提供电子往来港澳通行证签注剩余次数的查询服务，并可为持证人打印提示条。港澳地区主管部门将在其总部及部分口岸(主要是海港码头口岸)设置自助咨询台，为持证人本人提供查询签注信息服务，相关信息通过计算机屏幕显示，不提供打印的提示条。

电子往来港澳通行证二维码读取签注信息

证件背面，还有一个二维码，供管理部门在必要情况下使用。例如，在口岸查验时，如证件芯片损坏，可以通过二维码来读取签证信息进行验放