一、申请时所需材料不同

商标注册：所申请的商标图样，申请者的身份证、企业营业执照。

版权登记：准备作品登记申请书、作品登记表、权利保证书各一份，还有作品的原件及复印件、作品说明书(包括作品的构思、作品的特点等)。

二、保护的对象和范围不同

著作权是作者所创作出的作品，包括文学、艺术和科学作品。所保护的对象是上述的实质作品。

商标是以文字、图形或者组合而成的注册商标。所保护的对象是无形资产。对商标的保护范围是以核准注册的商标核定的使用的商品为限。

三、保护的目的不同

著作权的保护主要是在于鼓励更多人创作和传播更多有益于社会的作品，从而促进社会主义文化和科学事业的发展。

商标的保护目的是为了保证更多商品的商品质量和维护商标信誉，以保障消费者的权益。还有商标的保护期限也有不同，商标是保护十年，而版权则是保护终身。