商铺土地使用证的使用存在风险是：

(一)从法律角度来讲，房产证和土地证是房主拥有该房产以及土地使用权的证明，两者是密不可分的，没有土地证就意味着房主不具备对该土地的使用权，那么在该土地被人侵占的时候，业主将无法维护自己的合法权益；

(二)虽然房产证在自己手里，但土地使用权仍属于房地产开发商，我们不能排除开发商以该土地使用权“大证”像银行抵押贷款的风险；

(三)将来土地使用证和房产证不齐，不能上市进行二次交易；

(四)没有土地使用证，拆迁安置时，房主只能得到地上建筑部分的补偿，而得不到土地部分的补偿。最为关键的是，期限届满，不能申请自动延期。

一、土地使用证有什么作用

土地使用证是非常重要的物权，不按合同办出土地使用证就是开发商违约和对业主“权力”的侵犯。国有土地使用证不仅是住宅不动产的物权的组成部分，而且是更重要的组成部分。

(一)可以有效保护不动产产权的完整性。

缺少《土地使用证》，不动产的“物权”不完整。因为《房地产管理法》第五十九条规定：“国家实行土地使用权和房屋所有权登记发证制度”，这说明房地产的“物权”包括房屋所有权和土地使用权两方面。业主买的房地产包括房屋所有权和土地使用权，而现在开发商只把房屋所有权给了业主，而土地使用权没有交给业主。

(二)可以保证房产转让中涉及的土地使用权的法律效力。

缺少《土地使用证》，房地产的转让中涉及土地使用权的部分不发生法律效力。《民法典》第二百零九条规定：“不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力”。没有《国有土地使用证》，业主不拥有法律意义上的“土地使用权”。

(三)可以有效体现房地产的实际价值。

缺少《国有土地使用证》房地产价值严重缩水。按照《民法典》第三百五十九条规定：“住宅建设用地使用权期间届满的，自动续期”。这一条规定使原本只有70年寿命的住宅，得到“自动”延长。使“住宅”的传世私有财产性质，以法律的形式确立下来。但是如果买的房子没有《国有土地使用证》，就没有土地使用权，更不能“传世”，这样的房子没有多少价值。