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根据个人所得税的计算方法是：个人所得税税额=应纳税所得额×适用税率-速算扣除数。 个人所得税的免征额是3500元；社会保险费用不需缴纳个人所得税，所以应纳税所得额=个人收入所得额（扣除社保费用后）-免征额； 适用税率和速算扣除数需要根据应纳税所得额的范围来选择： 应纳税所得额不超过1500元的税率是3%，速算扣除数为0； 超过1500元但不超过4500元的税率是10%，速算扣除数为105； 超过4500元但不超过9000元的税率是20%。速算扣除数为555； 超过9000元但不超过35000元的税率是25%，速算扣除数为1005； 超过35000元但不超过55000元的税率是30%，速算扣除数为2755； 超过55000元但不超过80000元的税率是35%，速算扣除数为5505； 超过80000元的税率是45%，速算扣除数为13505。
根据我国税法规定，“个人所得税以所得人为纳税义务人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。工资、薪金所得应纳的税款，按月计征，由扣缴义务人或者纳税义务人在次月十五日内缴入国库，并向税务机关报送扣缴税款报告表。”所以员工的个人所得税由公司按月扣除。
个人所得税时如何扣除住房公积金一、退休人员取得原单位发放的过节费是否需要缴纳个人所得税答：根据《国家税务总局关于离退休人员取得单位发放离退休工资以外奖金补贴征收个人所得税的批复》(国税函〔2008〕723号)的规定：离退休人员除按规定领取离退休工资或养老金外，另从原任职单位取得的各类补贴、奖金、实物,不属于《中华人民共和国个人所得税法》第四条规定可以免税的退休工资、离休工资、离休生活补助费。根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例的有关规定，离退休人员从原任职单位取得的各类补贴、奖金、实物，应在减除费用扣除标准后，按“工资、薪金所得”应税项目缴纳个人所得税。因而单位在给退休人员发放过节费时应按上述规定代扣代缴个人所得税。二、解除劳动关系取得的一次性补偿收入是否要缴纳个人所得税根据《财政部、国家税务总局关于个人与用人单位解除劳动关系取得的一次性补偿收入征免个人所得税问题的通知》(财税〔2001〕157号)文件规定：个人因与用人单位解除劳动关系而取得一次性补偿金(包括用人单位发放的经济补偿金、生活补助费和其他补助费)，其收入在当地上年职工年平均工资的3倍数额内，免征个人所得税;超过的部分按照《国家税务总局关于个人因解除劳动合同取得经济补偿金征收个人所得税问题的通知》(国税发〔1999〕178号)的有关规定，计算征收个人所得税。另根据国税发〔1999〕178号文的有关规定：考虑到个人取得的一次性经济补偿收入数额较大，而且被解聘的人员可能在一段时间内没有固定收入，因此，对于个人取得的一次性经济补偿收入，可视为一次取得数月的工资、薪金收入，允许在一定期限内进行平均。具体平均办法为:以个人取得的一次性经济补偿收入，除以个人在本企业的工作年限数，以其商数作为个人的月工资、薪金收入，按照税法规定计算缴纳个人所得税。个人在本企业的工作年限数按实际工作年限数计算，超过12年的按12计算。三、在计算个人所得税时如何扣除住房公积金根据《财政部、国家税务总局关于基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、住房公积金有关个人所得税政策的通知》(财税〔2006〕10号)规定：单位和个人分别在不超过职工本人上一年度月平均工资12%的幅度内，其实际缴存的住房公积金，允许在个人应纳税所得额中扣除。单位和职工个人缴存住房公积金的月平均工资不得超过职工工作地所在设区城市上一年度职工月平均工资的3倍，具体标准按照各地有关规定执行。单位和个人超过上述规定比例和标准缴付的住房公积金，应将超过部分并入个人当期的工资、薪金收入，计征个人所得税。
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