医保卡个人账户的余额不会转到大病补助里，还是在自己的账户上，随时可以使用。城镇职工医疗保险单位和个人所缴纳的钱划分为两部分：一、个人账户（俗称医保卡）；二、统筹账户。每月都会从所缴费用当中按比例分配到这两个账户，换句话讲医保卡就是所缴保费中一部分的累计，可以供个人自由支配，支付门诊、到定点药店购买药品，以及支付住院费用当中自付额部分。同时，因病住院治疗需要统筹账户支付费用时，医保卡就是一个记账凭证（前提是有持续缴费）。一般医院的做法是入院时凭医保卡登记，所有的属于医保范围内的医疗费用直接由社保中心设在医院的结算中心直接与医院结算，自己只需支付自付额部分就行。当然、假如医保卡内有足够的余额（一般得累计很长时间），就用医保卡刷卡支付，如果不够，就由现金支付。
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办理医保转移手续首先要在原参保地办理医疗保险关系注销手续，然后由本人向市社保中心提出医疗保险关系转移申请，凭转出地经办机构出具的《参保（合）凭证》以及原参保地医疗保险缴费凭证，填写《医疗保险关系转移申请表》到市社保基金结算中心办理医疗保险关系和个人账户转移手续。
社保卡医疗账户余额不能取出，只能报销，因为根据《中华人民共和国社会保险法实施细则》，职工离职后，只有当生病、就医，在协议医疗机构发生的医疗费用，符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准的，才可以申请报销医保。
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