专用发票除具有普通发票的功能与作用外，还是纳税人计算应纳税额的重要凭证，与普通发票相比，它有以下区别： (一)使用范围不同 专用发票一般用于一般纳税人之间从事生产经营增值税应税项目使用;而普通发票则可以用于所有纳税人的所有经营活动，当然也包括一般纳税人生产经营增值税应税项目。 (二)作用不同 普通发票只是一种商事凭证，而专用发票不仅是一种商事凭证，还是一种扣税凭证。 (三)票面反映内容不同 专用发票不但要包括普通发票所记载的内容，而且还要记录购销双方的税务登记号、地址、电话、银行帐户和税额等。 (四)联次不同 专用发票不仅要有普通发票的联次，而且还要有扣税联。 (五)反映的价格不同 普通发票反映的价格是含税价，税款与价格不分离;专用发票反映的是不含税价，税款与价格分开填列。
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联次不同，专用发票有3联，普通发票则分好几种， 1、2、5联都有。发票使用人不同，专用发票一般只能由增值税一般纳税人领购使用，普通发票由从事经营活动并办理了税务登记的各种纳税人使用。作用不同，专用发票可以抵扣进项税，普通发票除特殊情况，是不能抵扣进项税额的。
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