人民检察院对于公安机关应当立案侦查而不立案侦查的线索进行审查后，应当根据不同情况分别作出处理：（一）没有犯罪事实发生，或者犯罪情节显著轻微不需要追究刑事责任，或者具有其他依法不追究刑事责任情形的，及时答复投诉人或者行政执法机关；（二）不属于被投诉的公安机关管辖的，应当将有管辖权的机关告知投诉人或者行政执法机关，并建议向该机关控告或者移送；（三）公安机关尚未作出不予立案决定的，移送公安机关处理；（四）有犯罪事实需要追究刑事责任，属于被投诉的公安机关管辖，且公安机关已作出不立案决定的，经检察长批准，应当要求公安机关书面说明不立案理由。
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需要由人民检察院直接受理的时候，人民检察院经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院立案侦查。人民检察院认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查的，或者被害人认为公安机关对应当立案侦查的案件而不立案侦查，向人民检察院提出的，人民检察院应当要求公安机关说明不立案的理由。
检察院立案侦查一般不属于立案调查。立案调查是监察委的常用说法，指国家工作人员涉嫌违纪、违法问题，由监察委予以立案，通常下一步措施是两规，查实后进行党纪政纪处分，如涉嫌犯罪则移送司法机关。立案侦查是公安或检察机关常用说法，指嫌疑人涉嫌违法犯罪问题，由司法机关予以立案。
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