不合法。关于旷工扣款这个要看公司规章制度是如何规定的，每个单位情况不一样，以实际情况为准。而且规章制度必须经过了民主程序，必须公示。劳动法和劳动合同法都没有对旷工行为如何处理的规定，只是规定对员工违反企业规章制度的违纪行为企业有权做出相应的处理，单位的规章制度要经过民主程序进行公示，而且必须是合法有效并且已经送达给员工的，这样才有效。规章制度对旷工行为概念和发生旷工有明确规定的，按具体的处理规定结合员工的实际旷工行为进行处理。关于违约金和罚金的问题，首先从2008年1月1日后除了培训费和竞业禁止或给单位造成直接经济损失外员工不承担其他违约责任。还有罚金的问题首先针对旷工当日的工资单位依法不予发放，但是额外扣的罚款就没有依据了。所以综上所述，单位有权决定扣款标准，但是那个旷工每天算三天，额外扣20%是不合法的，只能对旷工当日的工资不予发放，除此之外的扣罚就是没有法律依据的。
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《企业职工奖惩条例》第十一条之规定，对违反劳动纪律经常旷工的，经批评教育不改的，企业有权分别情况给予行政处分或者经济处罚。同时第十三条规定：“对职工罚款的金额由企业决定，一般不要超过本人月标准工资的百分之二十”。第十八条规定：“职工无正当理由经常旷工，经批评教育无效，连续旷工时间超过十五天，或者一年内累计旷工时间超过三十天的，企业有权予以除名”。因此，即使公司因你旷工给予经济处罚，也不得超过你月标准工资的百分之二十，更不能将你一月份的工资全部扣除。为了避免公司对你罚款及除名，如果一月份的工资按劳动合同的约定应在二月十一日之前支付，建议你按照《劳动法》第三十二条 （三）项之规定：“用人单位未按照劳动合同约定支付劳动报酬或者提供劳动条件的，劳动者可以随时解除劳动合同”，从而避免你的风险。
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