个人转让股权的应纳税所得额为转让股权的收入额减除股权原值和合理费用后的余额，应纳税所得额乘以20%的税率即为个人应当缴纳的个人所得税数额，其计算公式为：股权转让应缴纳的个人所得税=(股权转让收入-取得股权所支付的金额-转让过程中所支付的相关合理费用)×20%.个人转让股权所得税按照公平交易价格计算并确定计税依据。如有下列情形之一且无正当理由的，可视为计税依据明显偏低： 1.申报的股权转让价格低于初始投资成本或低于取得该股权所支付的价款及相关税费的; 2.申报的股权转让价格低于对应的净资产份额的; 3.申报的股权转让价格低于相同或类似条件下同一企业同一股东或其他股东股权转让价格的; 4.申报的股权转让价格低于相同或类似条件下同类行业的企业股权转让价格的;5.经主管税务机关认定的其他情形。
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个人所得税的应纳税额=应纳税所得额×适用税率-减免税额-抵免税额。以工资为例，应纳税所得额为每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除等扣除后的余额。而税率为3%至45%的超额累进税率。
在我国自然人转让股权的所得应当属于财产转让所得项目，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额为应纳税所得额，按20%税率缴纳个人所得税，按次征收。个人所得税是调整征税机关与自然人之间在个人所得税的征纳与管理过程中所发生的社会关系的法律规范的总称。
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