宅房屋与商用房的补偿的前提是对这房屋用途的认定，一般是按照房产登记证上登记的用途来进行划分的。但我国房屋产权产籍证书历来管理不规范，尤其是拆迁片区的一些列入旧城改造范围的一些房屋，多登记为住宅用途。拆迁实践中各地认定不一致，有的地方认定拆迁房为营业用房，要求提供营业执照，同期纳税证明，房产证上的坐落位置与上述位置相一致即能进行认定营业房屋。 按照国务院《城市房屋拆迁管理条例》规定的不管是商用还是住宅补偿安置方式上看不大，都是货币补偿和产权调换这两种方式，但在拆迁评估的评估方法上存在差异。住宅房屋一般采用市场比较法进行估价，商用店铺由于缺乏同一区域位置出售的可比照案例，多采用现行收益法进行估价。不同的估价方法和估价策略最终将会影响到价值量存在很大的差异，反映到补偿价格上营业用房单位面积的补偿价格远远高于住宅用途房屋。
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自家商用的住房遭遇拆迁时，政府拆迁部门应当给予以下补偿： 1、房屋价值补偿； 2、临时安置补偿； 3、搬迁费补偿； 4、搬迁奖励、补助。就上述补偿，政府拆迁部门应与被拆迁人协商签订拆迁补偿协议，确定具体的补偿方式和补偿金额。自家商用的住房遭遇拆迁时，政府拆迁部门是否给予停产停业损失补偿，要根据实际情况判断
被拆迁房屋的房地产补偿费由四部分组成，即： 1、房屋本身的市场价格，当然市场价格并非简单推测或者通过询问确定，起必须经过依法评估进行确定，被拆迁人如果对此不同意或者认为评估存在违法侵害利益的行为，应该依法复议诉讼； 2、附属设施补偿值注意，普通单元式楼房没有此项； 3、超额土地补偿值； 4、附属物及装修补偿。
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