最主要的区别就是适用的主体不同，合伙企业法规范的合伙企业之间的事项，公司法规定的是公司之间的事项。合伙企业仅仅缴纳个人所得税，不需缴纳企业所得说，而公司需要缴纳企业所得税；合伙企业分为普通合伙企业和有限合伙企业，公司分为股份有限公司和有限责任公司；合伙企业的一切属于合伙人，公司有自己独立的财产；合伙企业的普通合伙人以自己的财产承担无限连带责任，公司仅仅以自己所有的财产承担责任，公司的股东不承担连带责任，公司具有独立的法人格；合伙企业的合伙人必须不少于两人，公司可以有一人公司；合伙企业对出自的多少没有限制，公司有最低注册资本的限制；有限合伙企业中必须有普通合伙人，公司中股东没有这种区别；合伙企业的人合性强，公司的资合性强。合伙协议适用于合伙企业；公司章程适用于公司，而这的内容不完全相同。
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1、承担责任不同，合伙企业承担无限连带责任，即合伙人共负盈亏，合伙人个人的财产也需要还企业的债务。公司承担的是有限责任，即以公司的财产承担公司的债务，不足部分股东个人财产不承担。 2、缴纳的税种不一致，合伙企业缴纳个人所得税，公司缴纳企业所得税。 3、地位不同，合伙企业没有法人资格，属于企业组织形式。公司有独立的法人资格。
(1)有限责任公司，又称有限公司，由50名以下的股东出资设立，每个股东以其所认缴的出资额对公司承担有限责任，公司以其全部资产对其债务承担责任的经济组织。合伙企业，是指自然人、法人和其他组织依照本法在中国境内设立的普通合伙企业和有限合伙企业。 (2)承担责任形式不同：有限责任公司，属于企业法人，有独立的法人财产，享有法律财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任。合伙企业由普通合伙人和有限合伙人组成，普通合伙人对合伙企业债务承担无限连带责任，有限合伙人以其认缴的出资额为限对合伙企业债务承担责任。除此之外，还有出资方式、注册资金、企业行为依据、税收缴纳要求、企业债务承担方面区别。
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