员工在工作过程中，突发疾病，是不能判定为工伤的。单位可以不用进行赔偿。建议员工直接起诉单位，要求单位承担部分责任（因超时加班等原因）。 依据《工伤保险条例》 第十五条职工有下列情形之一的，视同工伤： （一）在工作时间和工作岗位，突发疾病死亡或者在48小时之内经抢救无效死亡的； （二）在抢险救灾等维护国家利益、公共利益活动中受到伤害的； （三）职工原在军队服役，因战、因公负伤致残，已取得革命伤残军人证，到用人单位后旧伤复发的。 职工有前款第（一）项、第（二）项情形的，按照本条例的有关规定享受工伤保险待遇；职工有前款第（三）项情形的，按照本条例的有关规定享受除一次性伤残补助金以外的工伤保险待遇。
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上班时间突发疾病一般是不能认定为工伤的。 但是，在工作岗位上突发与工作无关并没有导致立即死亡的疾病，在48小时内经抢救无效死亡的，视同为工伤。
根据我国法律规定，需要具体情况具体分析，对于在工作时间和工作岗位，突发疾病死亡或者在48小时之内经抢救无效死亡的视同工伤；对于因工作原因突发疾病的情形，也属于工伤；但是对于因自身原因导致的疾病是不属于工伤的。
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