第四十六条发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决;不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。第四十七条双方当事人协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议。的，应当制作协议书。协议书应当载明双方当事人的基本情况和医疗事故的原因、双方当事人共同认定的医疗事故等级以及协商确定的赔偿数额等，并由双方当事人在协议书上签名。第四十八条已确定为医疗事故的，卫生行政部门应医疗事故争议双方当事人请求，可以进行医疗事故赔偿调解。调解时，应当遵循当事人双方自愿原则，并应当依据本条例的规定计算赔偿数额。经调解，双方当事人就赔偿数额达成协议的，制作调解书，双方当事人应当履行;调解不成或者经调解达成协议后一方反悔的，卫生行政部门不再调解。第四十九条医疗事故赔偿，应当考虑下列因素，确定具体赔偿数额： (一)医疗事故等级; (二)医疗过失行为在医疗事故损害后果中的责任程度; (三)医疗事故损害后果与患者原有疾病状况之间的关系。不属于医疗事故的，医疗机构不承担赔偿责任。
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(一)医患双方协商解决，双方当事人在自愿的前提下可以自行协商解决，并签订协议书，双方当事人应当自觉履行协议书中的规定。 (二)申请医疗事故技术鉴定，当事人向医疗机构所在地的县(区)卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请，卫生行政部门自收到医疗事故争议处理申请之日起10日内进行审查。对符合《医疗事故处理条例》规定的，予以受理，需要进行医疗事故技术鉴定的，移交全医学组织鉴定;对不符合条例规定的，不予受理。 (三)诉讼解决。所谓诉讼解决是指通过法院的审理来解决医疗事故纠纷。诉讼在处理医疗事故纠纷中的作用，随着社会的发展和人们法制观念的重视和提高，正变得越来越重要。
医疗事故中医院的民事责任一般有缔约过失责任、违约责任、侵权责任等。其中，违约责任，指当事人双方不履行合同债务时，依法产生的法律责任。根据民法典的规定，患者在诊疗活动中受到损害，医疗机构或者其医务人员有过错的，由医疗机构承担赔偿责任。
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