若土地纠纷是涉及到拆迁的话，因为通常拆迁赔偿是按照房产证的，不是按照土地证的。 房屋拆迁补偿的法律程序如下： 一、拆迁单位向房屋所在地的市、县人民政府房屋拆迁管理部门取得拆迁许可证。 二、房屋拆迁管理部门在发放房屋拆迁许可证的同时，应当将房屋拆迁许可证中载明的拆迁人、拆迁范围、拆迁期限等事项，以房屋拆迁公告的形式予以公布。 三、房屋拆迁管理部门和拆迁人应当及时向被拆迁人做好宣传、解释工作。 四、拆迁人与被拆迁人应当依照法律的相关规定，就补偿方式和补偿金额、安置用房面积和安置地点、搬迁期限、搬迁过渡方式和过渡期限等事项，订立拆迁补偿安置协议。拆迁租赁房屋的，拆迁人应当与被拆迁人、房屋承租人订立拆迁补偿安置协议。 五、拆迁人与被拆迁人或者拆迁人、被拆迁人与房屋承租人达不成拆迁补偿安置协议的，经当事人申请，由房屋拆迁管理部门裁决。房屋拆迁管理部门是被拆迁人的，由同级人民政府裁决。裁决应当自收到申请之日起30日内作出。 当事人对裁决不服的，可以自裁决书送达之日起3个月内向人民法院起诉。拆迁人依照本条例规定已对被拆迁人给予货币补偿或者提供拆迁安置用房、周转用房的，诉讼期间不停止拆迁的执行。 六、拆迁补偿安置协议订立后，被拆迁人或者房屋承租人在搬迁期限内拒绝搬迁的，拆迁人可以依法向仲裁委员会申请仲裁，也可以依法向人民法院起诉。诉讼期间，拆迁人可以依法申请人民法院先予执行。 七、被拆迁人或者房屋承租人在裁决规定的搬迁期限内未搬迁的，由房屋所在地的市、县人民政府责成有关部门强制拆迁，或者由房屋拆迁管理部门依法申请人民法院强制拆迁。实施强制拆迁前，拆迁人应当就被拆除房屋的有关事项，向公证机关办理证据保全。
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无证房屋拆迁是应该有补偿的。一些房屋是70年代或者更早为五六十年代形成的，在那个时期需要很少的手续就可以建成，但是用现在的法律要求进行分析是能归为违章建筑的，这是不可取的，必须要结合建筑物形成时期的法律规定进行确定是否合法。
不少地方在拆迁当中，为了压低拆迁成本，于是对无证房屋一律不补偿或者压低价格补偿，这种做法是不合理也不合法的。无证房屋并不等于就是违法建筑，尤其是在我国的广大农村，大量的无证房屋存在，很多房屋建筑年代较早，是一家人唯一的房产，如果按照违法房产拆迁不补偿或者压低补偿，则必然导致很多家庭失去唯一居所或者居住条件大幅度降低，因此，对于无证房屋，应当根据其形成原因区分为违法建筑和合法房产，对于无证的合法房产，拆迁当中应当与其他有证房屋一样，给予公平合理的补偿。一般来说，农村建于2008年之前房屋，家庭的唯一住房，年代久远的祖遗房，即便无证，在征地拆迁时，也应当给予公平合理的补偿。因此，无证房屋是否应该补偿，要结合具体情况来分析。
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