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办理专利申请权转让的方式： 1.转让方与受让方就转让相关事宜达成协商，并订立书面协议。 2.双方共同向国务院专利行政部门申请登记。 3.由国务院专利行政部门予以公告。专利申请权或者专利权的转让自登记之日起生效。
专利权转让与专利申请权转让两者既有相同之处，也有本质上的区别：专利权转让中订立合同的标的是专利权，而专利申请权转让合同的标的是专利申请权；专利权转让发生在专利授权之后，转让人为专利权人，而专利申请权转让则发生在专利授权之前，转让人为专利申请人。
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