股权转让表面上看是一件简单的事情，但其实转让风险存在于交易的整个过程，有法律风险，有市场风险，也有道德风险。公司章程对股权转让很重要，公司章程作为公司的自治纲领，任何经股东会通过并经登记机关备案的章程公司、股东等都必须遵守，与公司章程相抵触的行为都会被撤销，股权转让协议也不例外。所以在股权转让前，受让方必须要了解公司章程是否作出了与法律不一致的特殊规定，比如有的公司章程禁止股东向股东以外的人转让股权，那么受让方就没有必要再继续进行股权转让协商的必要；如果公司章程规定的股东向股东以外的人转让股权的程序比法律规定更加严格，那么转让方与受让方也必须遵守。
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股权转让协议的法律风险及管控：了解是否存在纯义务性条款和其他限制性条款；查询目标公司重大债务的偿还情况；目标公司是否有正在进行的诉讼、仲裁及行政处罚；调查是否存在影响目标公司合法存续的重大法律障碍等；其他法律风险及管控。
有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权，《股权转让协议书》系双方当事人的真实意思表示，符合自愿、公平的原则，且没有违反法律和行政法规的强制性规定以及公司章程的规定，公司股东对此亦表示一致同意，该协议自签订之日起成立并生效。此外，虽然股东转让出资要进行股东变更登记，但对于股权转让协议，法律并无必须登记才生效的规定，且股东变更登记是对股东变更的公示方式，未办理登记只是使得该股权转让行为原则上对公司以外不产生法律效力，而并不影响股权转让协议本身的效力，该协议对股权转让各方仍具有法律效力。所以股权转让协议和工商登记不符并不影响两者的效力。若工商管理机关不予办理变更登记手续可以有以下几个处理办法： (一)受让股东可以向人民法院提起诉讼，要求确认股权转让协议有效，并强制转让，由工商管理机关依据生效判决变更股权登记。 (二)受让股东也可依据股权转让协议及其他变更文件，提起行政诉讼，起诉工商管理机关履行变更登记的职责。
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