宅房屋与商用房的补偿的前提是对这房屋用途的认定，一般是按照房产登记证上登记的用途来进行划分的。但我国房屋产权产籍证书历来管理不规范，尤其是拆迁片区的一些列入旧城改造范围的一些房屋，多登记为住宅用途。拆迁实践中各地认定不一致，有的地方认定拆迁房为营业用房，要求提供营业执照，同期纳税证明，房产证上的坐落位置与上述位置相一致即能进行认定营业房屋。 按照国务院《城市房屋拆迁管理条例》规定的不管是商用还是住宅补偿安置方式上看不大，都是货币补偿和产权调换这两种方式，但在拆迁评估的评估方法上存在差异。住宅房屋一般采用市场比较法进行估价，商用店铺由于缺乏同一区域位置出售的可比照案例，多采用现行收益法进行估价。不同的估价方法和估价策略最终将会影响到价值量存在很大的差异，反映到补偿价格上营业用房单位面积的补偿价格远远高于住宅用途房屋。
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商品房拆迁补偿标准：依据当地政策确定。各地标准不一。房屋补偿费：用于补偿被拆迁房屋所有权人的损失。以被拆迁房屋的结构和折旧程度划档，按平方米单价计算。周转补偿费：用于补偿被拆迁房屋住户临时居住房或自找临时住处的不便，以临时居住条件划档，按被拆迁房屋住户的人口每月予以补贴。奖励性补偿费：用于鼓励被拆迁房屋住户积极协助房屋拆迁，或主动放弃一些权利，如自愿迁往郊区或不要求拆迁单位安置住房，房屋拆迁补偿费的各项标准由当地人民政府根据本地的实际情况和国家有关法律政策加以确定。
1、若房屋和土地分开补偿，则土地按商业用途补偿，房屋及其附属物按重置成新价补偿。此外，还有搬迁补助、正常营业的还有停产停业损失。 2、如房地合一补偿，则按照商业房地产市场价值(评估确定)进行补偿。此外，也有搬迁补助、正常营业的还有停产停业损失。
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