辞职后公司最后一个月工资中社会保险会代扣到你社会在本企业的中止日期，如果没有中止交费则须代扣个人应缴纳的部分。 用人单位代扣代缴社保是公司提法定义务与责任，用人建立了社保关系则要按规定交缴纳个人应缴部分，否则会造成断交费问题，与劳动者是不利的。 同时，社保缴费都是公司缴费（大部分）＋个人缴费（小部分）来构成，从情理法理上最后一个月工资都应扣个人应缴费部分。在解除劳动合同关系时公司应出具解除合同证明给你，写明你的社保缴纳基本情况，截至月份等。
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