公司辞退员工的补偿扣税：1、财政部、国家税务总局对此有明确的规定，具体依据是《关于个人与用人单位解除劳动关系取得的一次性补偿收入征免个人所得税问题的通知》。根据此《通知》的规定，单位支付给劳动者的一次性经济补偿金收入（包括经济补偿金、生活补助费和其他补助费用），若在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税；超过的部分，应按相关规定，由单位代扣代缴个人所得税。 2、上税部分的计算方法依据《关于个人因解除劳动合同取得经济补偿金征收个人所得税问题的通知》规定，对于一次性经济补偿金超过上年职工平均工资3倍数额的部分应缴税数额，应按“工资、薪金所得”项目计征个人所得税。 3、考虑到个人取得的一次性经济补偿收入数额较大，而且被解聘的人员可能在一段时间内没有固定收入，因此，对于个人取得的一次性经济补偿收入，可视为一次取得数月的工资、薪金收入，允许在一定期限内进行平均。 具体平均办法为：以个人取得的一次性经济补偿收入，除以个人在本企业的工作年限数，以其商数作为个人的月工资、薪金收入，按照税法规定计算缴纳个人所得税。个人在本企业的工作年限数按实际工作年限数计算，超过12年的按12计算。
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解除劳动合同的经济补偿金，在当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税；超过3倍数额的部分，个人所得税=【应纳税额/工作年限（超过12年按12年计算）-免征额5000】*适用税率-速算扣除数。
公司辞退员工补偿金不一定要纳税，因为根据《财政部、税务总局关于个人所得税法修改后有关优惠政策衔接问题的通知》，如果劳动者获得的经济补偿金的总数额不超过当地上年职工平均工资3倍的，不需要缴纳个人所得税。
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