结婚证丢失后，夫妻有两种方法来协议离婚：一种是带上身份证到发证的婚姻登记处（结婚窗口）查找结婚登记档案，婚姻登记部门出具查档证明，当事人双方带着户口本、身份证、查档证明和三张大两寸合影相片到当事人一方的户口所在地的婚姻登记部门补办结婚证，也可以到存档的婚姻登记部门补发结婚证。补好结婚证后，双方便可到民政部门协议离婚，办理离婚证。另一种方法是不需要补办结婚证，直接去民政局开具婚姻状况证明，即可以办理离婚登记。 若是起诉的一方结婚证丢失，起诉的一方可先到原结婚登记的民政局找婚姻档案或委托律师去民政局调取结婚档案即可，出具本人的婚姻登记记录证明，来证明双方的婚姻关系。然后起诉离婚的一方拿着本人身份证明、结婚证明、感情破裂的证据、起诉书到法院立案即可。
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当事人有一本结婚证丢失的，婚姻登记机关可根据另一本结婚证办理离婚登记；两本结婚证都丢失的，夫妻有两种方法来协议离婚： 1、一种是带上身份证到发证的婚姻登记处（结婚窗口）查找结婚登记档案，婚姻登记部门出具查档证明，当事人双方带着户口本、身份证、查档证明和三张大两寸合影相片到当事人一方的户口所在地的婚姻登记部门补办结婚证，也可以到存档的婚姻登记部门补发结婚证。补好结婚证后，双方便可到民政部门协议离婚，办理离婚证。 2、另一种方法是不需要补办结婚证，直接去民政局开具婚姻状况证明，即可以办理离婚登记。
结婚证丢失的，双方是没办法协议离婚的。因为协议离婚必须双方持有结婚证、户口簿、身份证办理。但双方可以选择先补办结婚证再办理离婚登记手续，或者是一方直接向人民法院提起离婚诉讼。
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