可以协商离婚和对孩子抚养权进行协商处理。协商不成的可以起诉离婚，小孩一般法院会判决由抚养条件更好的一方直接抚养，或一人一个小孩。《最高人民法院关于人民法院审理离婚案件处理子女抚养问题的若干具体意见》 1、两周岁以下的子女，一般随母方生活。母方有下列情形之一的，可随父方生活： (1)患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的； (2)有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的； (3)因其他原因，子女确无法随母方生活的。 2、父母双方协议两周岁以下子女随父方生活，并对子女健康成长无不利影响的，可予准许。 3、对两周岁以上未成年的子女，父方和母方均要求随其生活，一方有下列情形之一的，可予优先考虑： (1)已做绝育手术或因其他原因丧失生育能力的； (2)子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利的； (3)无其他子女，而另一方有其他子女的； (4)子女随其生活，对子女成长有利，而另一方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或者有其他不利于子女身心健康的情形，不宜与子女共同生活的。 4、父方与母方抚养子女的条件基本相同，双方均要求子女与其共同生活，但子女单独随祖父母或外祖父母共同生活多年，且祖父母或外祖父母要求并且有能力帮助子女照顾孙子女或外孙子女的，可作为子女随父或母生活的优先条件予以考虑。 5、父母双方对十周岁以上的未成年子女随父或随母生活发生争执的，应考虑该子女的意见。
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有两个孩子想离婚的，双方可以协商子女抚养权的问题，协商不成的，可以向人民法院提起诉讼，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。 判决抚养的时候法院会参考孩子的年龄，性别等因素进行判决，通常情况下，两周岁以内的子女原则上女方抚养，两周岁到八周岁之间的子女法院会按照有利子女成长的原则判决，八周岁以上的子女可以征求孩子意见。
离婚时孩子的抚养权由双方协商处理。在有利于保护子女利益的前提下，可以由父母一方直接抚养，也可以双方轮流抚养。 协商不成的法院按照以下原则进行判决： 1.离婚时，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。 2.已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。 3.子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。 不直接抚养子女的一方应当支付抚养费。
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