应发工资，包括应缴纳的社保等。计算经济补偿金需要弄清晰发生劳动争议之日倒推十二个月的总收入计算出月平均工资，对于每个月的工资发放，应按应发工资计算，不考虑个人所得税或其他扣除。 劳动关系的解除有多种方式，双方协商解除是其中之一。但用人单位提出并与员工协商解除劳动关系的，应根据员工在本单位的工作年限支付经济补偿。《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》（劳部发[1994]481号）第五条经劳动合同当事人协商一致，由用人单位解除劳动合同的，用人单位应根据劳动者在本单位工作年限，每满一年发给相当于一个月工资的经济补偿金，最多不超过十二个月。工作时间不满一年的按一年的标准发给经济补偿。《上海市劳动合同条例》第四十二条有下列情形之一的，用人单位应当根据劳动者在本单位工作年限，每满一年给予劳动者本人一个月工资收入的经济补偿：(一)用人单位依据本条例第二十九条(参见)规定提出与劳动者解除劳动合同的。第二十九条经劳动合同当事人协商一致，劳动合同可以解除。本条例第四十二条(参见)中的本单位工作年限，满六个月不满一年的，按一年计算。以上条文说明单位提出与员工协商解除劳动关系，应根据员工在单位的工作年限支付经济补偿，每满一年支付一个月工资，不满一年满六个月的按一年计算。
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区分劳动者自动离职与解除合同的办法：自动离职一般属于违法解除劳动合同的一种行为，未经任何法定的程序就直接离职走人；而解除劳动合同还包括依法解约，要经过一定的程序。
解除劳动合同、辞职与自动离职的区别： 1、运用主体不同。解除劳动合同的运用主体可以是用人单位，也可以是劳动者。而辞职、自动离职的运用主体只是劳动者。 2、适用原因的性质不同。解除劳动合同适用的原因是双重性质的，既有惩罚性的，又有非惩罚性的。而辞职不具有惩罚性，自动离职往往是一种违法行为。
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