如果是因为劳动者的离职给公司造成了一定的损失，公司是可以从劳动者的工资中扣除一定的金额作为赔偿的，但是公司在员工自动离职不发放工资是不合法的。 给用人单位工作，有两个途径可以要求支付工资： 1、劳动者可以到当地劳动局劳动监察投诉；优点：方式简单。缺点：各地执法力度可能不是很大； 2、可以到当地劳动局（人力资源和社会保障局劳动争议仲裁委员会）申请仲裁，要求支付工资。如果未签订劳动合同，可以要求支付未签订劳动合同的双倍工资。如果是以拖欠工资提出的解除劳动关系，还可以要求支付经济补偿金。优点：除了工资外，还可以主张经济补偿、双倍工资等，并且一般都可以最终解决；缺点：申请劳动仲裁就是打劳动官司，程序稍多，需要专业人士指导。
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公司发放工资可以由企业直接发放，也可以由银行代发。通常工资是由劳动合同约定的，在发放工资的同时发放工资条，员工根据工资条有异议的，可以及时提出。
1、停工停产一个月内的，员工不干活，用人单位仍按照劳动合同约定的标准支付工资。 2、停产超出一个月的，则可以分两种情况发放工资： (1)若劳动者提供了正常劳动，则支付给劳动者的劳动报酬不得低于当地最低工资标准2)若没有提供正常劳动，则可以按低于最低工资标准的水平发放工资。也就是自第二月起，员工没有提供劳动，公司要支付当地最低生活保障，每个地区都有自己的规定。
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