对于股权投资，其评估方法一般都应用收益法。直接投资由于投资比重不同，可以分为全资投资、控股投资和非控股投资。对全资企业和控股企业的直接投资，用整体企业评估方式评估确定其净资产额。对控股企业，应按投资股权比例计算应分得的净资产额，即对该企业直接投资的评估值。如果被投资企业经过评估，净资产额为零或为负值时，对该企业的直接投资的评估值为零。对非控股的直接投资，一般应采用收益法进行评估。对投资份额很小，可根据被评估企业经过注册会计师审计的资产负债表上的净资产数额，再根据投资方应占的份额确定评估值。
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纳税评估指标是税务机关筛选评估对象、进行重点分析时所选用的主要指标，分为通用分析指标和特定分析指标两大类，使用时可结合评估工作实际不断细化和完善。 纳税评估指标的功能、计算公式及其分析使用方法参照《纳税评估通用分析指标及其使用方法》(附件1)、《纳税评估分税种特定分析指标及其使用方法》(附件2)。 纳税评估分析时，要综合运用各类指标，并参照评估指标预警值进行配比分析。评估指标预警值是税务机关根据宏观税收分析、行业税负监控、纳税人生产经营和财务会计核算情况以及内外部相关信息，运用数学方法测算出的算术、加权平均值及其合理变动范围，测算预警值，应综合考虑地区、规模、类型、生产经营季节、税种等因素，考虑同行业、同规模、同类型纳税人各类相关指标的若干年度的平均水平，以使预警值更加真实、准确和具有可比性。纳税评估指标预警值由各地税务机关根据实际情况自行确定。
有下列方法： 1、风险度评价法。风险度评价法是对投资风险事故造成损失的频率或者损害的严重程度进行的综合评估。 2、检查表评价法。 3、德尔菲法。大致流程是：在对所要预测的问题征得专家的意见之后，进行整理、归纳、统计，再匿名反馈给各专家，再次征求意见，再集中，再反馈，直到得到稳定的意见。 4、决策树法。决策树法是利用树枝形状的图像模型来表述投资风险评价问题，投资风险的评价可直接在决策树上进行。
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