不一定属于医疗事故。医疗纠纷涉及的专业性很强，需要做具体的鉴定才能确定。做肠镜导致肠穿孔有两方面的原因，一是医方在诊疗过程中违规操作导致，另一方面是由于患者自身的肠壁有原发性的破损或者肠壁很脆弱。具体的原因还需要做鉴定或者您可以将病历材料封存并复印邮寄给我们专业的医疗律师进行病历审查，判断医疗机构是否存在过错及损害后果的过错参与度大小，以此来主张权利。
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做肠镜时肠穿孔是否属于医疗事故要经过医疗技术鉴定才能判断。 但如果有以下情形导致事故发生的，一般不能认定为是医疗事故： （一）在紧急情况下为抢救垂危患者生命而采取紧急医学措施造成不良后果的； （二）在医疗活动中由于患者病情异常或者患者体质特殊而发生医疗意外的； （三）在现有医学科学技术条件下，发生无法预料或者不能防范的不良后果的； （四）无过错输血感染造成不良后果的； （五）因患方原因延误诊疗导致不良后果的； （六）因不可抗力造成不良后果的。
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