对于怎样申请专利保护，根据《专利法》第四条的规定，涉及国家安全或者重大利益的发明创造，需要按照有关规定申请保密专利。一般而言，涉及国家安全的发明创造主要是指国防专用或者对国防有重大价值的发明创造；涉及国家重大利益的发明创造是指涉及国家安全以外的其他重大利益的发明创造。这些发明创造的公开会影响国家的防御能力，损害国家的政治、经济利益或削弱国家的经济、科技实力。申请保密专利的发明创造不包括外观设计。据说凡是在中国完成的发明或者实用新型，向外国进行专利申请的，都必须先报国务院专利行政部门进行保密审查。根据法律规定，如果没有按照规定进行保密审查的，该发明或者实用新型在中国申请专利的，不授予专利权。
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专利申请涉及国防利益的处理是：申请专利的发明创造涉及国家安全或者重大利益需要保密的，按照国家有关规定办理。由国防专利机构受理并进行审查；国务院专利行政部门受理的专利申请涉及国防利益需要保密的，应当及时移交国防专利机构进行审查。
申请国家发明专利，需要经历以下程序： 一、申请人提交提交请求书、说明书及其摘要和权利要求书等材料； 二、专利政部门收到发明专利申请后十八个月内，进行初步审核，符合要求的，即行公布； 三、自申请日起三年内，对于通过实质审核的，发给发明专利证书，同时予以登记和公告。
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