应用控制是指在计算机会计数据处理过程中所实施的各种控制。一是电算化会计系统的数据输入控制。数据的正确输入是保证电算化会计系统正确输出的关键，这项控制主要包括数据接交、数据校验和数据的核对三方面的控制。二是电算化会计系统的数据处理控制。主要是对会计电算化系统进行的内部数据处理活动的控制措施，包括错误纠正、审核处理输出、处理有效性检测、数据有效性检验、保留审计线索等方面的控制。三是电算化会计系统的数据输出控制。一般包括输出时间的控制和数据处理正确性检查以及总数输出的控制等内容。具体表现为数据稽核控制、授权输出控制、时序控制三方面的内容。四是电算化会计系统的数据通讯控制。为了确保数据在传输过程中安全、可靠、准确的存在，要采用各种技术手段以维护数据通讯的完整性、可靠性，防止在传输过程中数据发生错误、丢失、泄密等事故。五是电算化会计系统的数据存储和检索控制。计算机输出的数据容易被更新、调用，必须对于输出的会计资料给予及时的保护。例如在输出的会计资料上贴上标签，然后在标签上写明文件的名称、输出的时间等一系列为了保护会计资料而必须写明的内容。对资料分发与保管设置登记簿，要详细的注明输出资料各个项目，并需要经过当时办理人的签字，以防止会计资料的丢失、错发、漏发。
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非法控制计算机信息系统罪是指对国家事务、国防建设、尖端科学技术领域以外的计算机信息系统实施非法控制，情节严重的行为。根据刑法第285条第二款的规定，犯本罪的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金;情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
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