自动离职用人单位应当结清工资，但劳动者应当赔偿损失。自动离职，指劳动者根据用人单位和自身情况擅自离职，而强行解除与用人单位的劳动关系的一种行为。因辞职或要求解除合同未准，擅自离职或违约出走；未说明原因不辞而别；受优厚待遇诱惑擅自“跳槽”等均属自动离职。属于违法解除合同，按照《劳动合同法》第九十条规定，对用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。用人单位要求劳动者赔偿损失的，应当承担举证责任。工资，是指用人单位依据劳动合同的规定，以各种形式支付给劳动者的工资报酬。劳动者付出了劳动，用人单位即应按照合同约定的标准支付报酬。根据劳动部《工资支付暂行规定》第九条规定，无论是解除合同是否合法，用人单位均应在解除合同之时一次性结清工资。赔偿损失与结清工资是不同是不同的法律关系，二者应当分别计算，合并结算。《劳动合同法》第九十条劳动者违反本法规定解除劳动合同，或者违反劳动合同中约定的保密义务或者竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。劳动部《关于实行劳动合同制度若干问题的通知》劳部发〔1996〕354号18．职工解除劳动合同，应当严格按照《劳动法》的规定，提前三十日以书面形式向用人单位提出。职工自动离职属于违法解除劳动合同，应当按照《违反〈劳动法〉有关劳动合同规定的赔偿办法》承担赔偿责任。劳动部《工资支付暂行规定》劳部发〔1994〕489号第九条劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
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员工自动离职后，用人单位应该支付工资。但是，如果劳动者自动离职给用人单位造成的损失，用人单位可以单独起诉劳动者要求该劳动者承担。如果用人单位拒绝支付工资，劳动者可以申请劳动仲裁，要求支付。
职工自动离职是否有工资，视具体情况而定。劳动者没有提前30天书面提出离职，用人单位也不存在违法情况，劳动者属于违法解除劳动合同。但用人单位应该全额支付劳动者工资。如果劳动者擅自离职给用人单位造成的直接经济损失，用人单位可从劳动者本人的工资中扣除，但扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
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