基本医疗保险统筹基金支付的住院和门诊大病医疗费用设立起付标准。一、二、三级定点医疗机构起付标准分别为200元、500元、800元，社区定点医疗机构起付标准按照一级定点医疗机构执行。参保人住院治疗，在一个年度内第一次住院的，起付标准按照100%执行;第二次住院的，起付标准按照50%执行;第三次及以上住院的，起付标准统一按照100元执行。参保人门诊大病治疗，在一个年度内负担一个起付标准。尿毒症透析治疗、器官移植、恶性肿瘤、精神病等门诊大病参保人个人负担的起付标准可以适当减免。
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1.5万元-6万元报销55%；6万元-10万元报销60%；10万元-15万元报销65%；15万元以上报销70%；转外院治疗的，统一报销比例为50%。 当然了，并不是所有的疾病都能享受二次报销，只有特定的一些病种才能享受，具体如下：儿童白血病、先心病、终末期肾病、唇腭裂、乳腺癌、宫颈癌； 重性精神疾病、耐药肺结核、艾滋病机会性感染、结肠癌、血友病、慢性粒细胞白血病、肺癌、食道癌、胃癌、等20种疾病可以享受新农合大病二次报销政策。
起付标准以下含本数的，由个人账户支付或个人自负。起付标准以上含本数的，基本医疗保险统筹基金最高支付限额以下的由基本医疗保险统筹基金和个人共同负担。其中个人负担额按下设分段与自负比例累加计算：1万元以下的个人自负比例按 一、 二、三类收费标准医疗机构分别为12%、9%、5%；1万元以上，基本医疗保险统筹基金最高支付限额以下的个人自负比例按 一、 二、三类收费标准医疗机构分别为8%、5%、4%；退休人员按以上自负比例的60%负担。基本医疗保险统筹基金最高支付限额以上，大病医疗互助基金最高支付限额以下的个人自负比例为6%，退休人员为4.8%。
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