一般专利许可合同，当事人签字即可生效；但按照专利法实施细则规定，应报专利局备案，涉外的专利许可合同，则应按照规定，分别批请对外经济贸易部或省、市、自治区以及计划单列市的对外经济贸易厅、局、委审批。 合同审批与备案 合同经过审批、生效后，执行合同的各项具体事务就由当事人双方来进行。由于不同合同标的不同以及其他差异等，合同的执行并无固定模式，基本原则是：双方都应自觉履行自己在合同上所承诺的义务。
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签订专利许可合同应当注意专利权人主体资格、专利权的存续期间和专利实施许可的范围。根据2021年实施的《民法典》第八百六十五条规定，专利实施许可合同仅在该专利权的存续期限内有效。专利权有效期限届满或者专利权被宣告无效的，专利权人不得就该专利与他人签订专利实施许可合同。第八百六十六条规定，专利实施许可合同的许可人应当按照约定许可被许可人实施专利，交付实施专利有关的技术资料，提供必要的技术指导。
依据专利实施许可合同备案办法的规定，签订专利许可合同后，要在合同生效三个月内向国家知识产权局申请备案。申请专利实施许可合同备案的，应当提交下列文件：(一)许可人或者其委托的专利代理机构签字或者盖章的专利实施许可合同备案申请表；(二)专利实施许可合同；(三)双方当事人的身份证明；(四)委托专利代理机构的，注明委托权限的委托书；(五)其他需要提供的材料。
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