1.公司这么做是为了在发生劳动争议的时候少支付加班工资或者补偿金等。劳动者的实际工资比劳动合同的工资高，劳动者务必要保存实际工资水平的证据，尤其是现金支付工资，务必保存好工资单。如果有劳动争议，公司往往会按劳动合同主张工资标准。如果劳动者不能证明实际工资水平的，仲裁委会按劳动合同确定工资标准，这样加班工资，补偿金等都会变少。 2.公司应当按照实际工资缴纳社保，如果按劳动合同上的工资缴纳社保，就少缴了，可以去社保局投诉，社保局可以责令公司补缴社保。公司少缴社保，劳动者可以单方解除劳动合同并要求支付经济补偿金。 3.《社会保险法》第八十六条用人单位未按时足额缴纳社会保险费的，由社会保险费征收机构责令限期缴纳或者补足，并自欠缴之日起，按日加收万分之五的滞纳金;逾期仍不缴纳的，由有关行政部门处欠缴数额一倍以上三倍以下的罚款。
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关于劳动合同工资与实际工资不符的问题，如果劳动者认为单位此举侵犯了自己的合法权益，可以通过劳动监察来要求重签合同和补缴社保。如果劳动者认可此劳动合同，一旦出现双方劳动纠纷，可以申请劳动仲裁，此时采用的工资标准一般是按实发工资核算的。 申请劳动仲裁流程如下： 1、去当地人力资源和社会保障局（原劳动局）内的劳动争议仲裁委，申请劳动仲裁，立案时需携带：仲裁申请书2份、申请人身份证复印件1份；相关证据复印件和证据清单2份；用人单位的工商登记信息。 2、提交材料后，5个工作日内仲裁委给予立案，然后给双方举证期，给对方答辩期；然后开庭审理，之后对你们双方进行调解，调解不成仲裁委会下达裁决书；劳动仲裁45天内结案；对于裁决书不服，可以起诉到法院。
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