向上一级公安机关或者人民检察院投诉。公安部《关于公安机关不得非法越权干预经济纠纷案件处理的通知》（〔89〕公（治）字30号）、《关于严禁公安机关插手经济纠纷违法抓人的通知》（公通字[1992]50号）、《关于严禁越权干预经济纠纷的通知》（公通字[1995]13号）对禁止公安机关插手经济纠纷有明确的规定，工作中，必须划清经济犯罪和经济纠纷的界限，决不能把经济纠纷当作诈骗等经济犯罪来处理。严禁非法干预经济纠纷问题的处理。对经济纠纷问题，应由有关企事业及其行政主管部门、仲裁机关和人民法院依法处理，公安机关不要去干预。更不允许以查处诈骗等经济犯罪为名，以收审、扣押人质等非法手段去插手经济纠纷问题。否则，造成严重后果的，要依法追究有关当事人和主管负责人的法律责任。各地公安机关承办经济犯罪案件，必须严格执行最高人民法院、最高人民检察院、公安部关于案件管辖的规定。要正确区分诈骗、走私等经济犯罪与经济合同纠纷的界限，准确定性。凡属债务、合同等经济纠纷，公安机关绝对不得介入。如果当事人确属经济纠纷，可以向上一级公安机关或者人民检察院投诉。
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公司经济纠纷发生后，当事人可以协商解决，也可以通过调解解决。 不愿协商调解的可以根据当事人之间达成的仲裁协议向中国仲裁机构申请仲裁。 如果是涉外合同的当事人没有订立仲裁可以向人民法院起诉。 当事人应当履行发生法律效力的判决、仲裁。
公司经济纠纷首先可以通过协商解决，这样双方绿履行的也会更快。还可以选择诉讼方式解决，不过需要耗费很长的时间和精力。根据相关法律规定，民事诉讼的管辖地可以由双方约定。
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