我国土地管理法第十三条规定，处理土地纠纷的机关是人民政府和人民法院。因农村责任田划分，宅基地的规划及调整和边界划分而引起的纠纷，属于行政部门处理的争议，而不应属于法院管辖。遇有此类情况，可向当地人民政府主管部门提出申请，予以解决。 法院受理的土地纠纷有两类：一类是行政案件，另一类是民事案件。 属于行政案件的几种情况：一是因土地权属不明、界限不清引起的土地使用权和所有权争议，可先根据《中华人民共和国土地管理法》第十三条的规定，自行协商，未果的，可由人民政府处理，对人民政府处理结果不服的，可在接到处理决定通知书的30日内向法院起诉;二是人民政府对土地所有权和使用权争议作出处理决定以后，如果对处理结果不服，且未在法定期限内申请复议的，可向人民法院提起行政诉讼;三是非法占用土地建房的，必须由主管机关先行处理，对未经批准或采用欺骗手段骗取批准，非法占用土地(宅基地)的，由乡镇人民政府或县级以上地方人民政府或县级以上地方人民政府土地管理部门依法予以行政处罚，当事人对行政处罚决定不服的，可以在接到处罚决定通知之日起15日内向法院提起行政诉讼。 属于民事案件的土地纠纷：一是土地使用权纠纷;二是土地所有权纠纷;三是土地使用权的出让和转让合同纠纷;四是土地出售、交换、出租抵押合同纠纷。另外不包括林木、林地的所有权和使用权纠纷以及宅基地使用权纠纷，都属于法院受理的民事案件范畴，应到法院民事审判庭起诉。 需要提供相关证据：在发生土地纠纷以后，应及时搜寻、保存证据，包括土地使用权证、房产证和各类合同书等。另外，还应提供历史上对发生争议的土地、宅基地的使用情况。涉及侵权的，还应提交侵权人的具体侵权行为和造成的后果等方面的证据。如果发生的纠纷经过有关部门处理，则还应提交该部门的处理意见。
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土地确权纠纷处理的一般方法有： 1、纠纷双方协商解决。双方当事人采取其他方式解决纠纷之前，首先在自愿互谅的基础上，依照有关法律规定，直接进行协商，自行解决双方之间的纠纷。 2、当地相关部门。如果双方当事人不愿意协商解决，或者通过协商未能解决纠纷（协商达成解决纠纷的协议后，一方当事人反悔的），可以向村民委员会、乡（镇）政府申请进行调解来解决纠纷。这个时候土地纠纷调解员的作用就体现出来了。 3、仲裁机构。调解都未能解决纠纷，那就向农村土地承包仲裁机构申请仲裁。 4、人民法院。如果当事人对仲裁结果不服的，可以在收到结果后30日内，以对方当事人为被告，向人民法院提起民事诉讼，通过诉讼方式保护自己的权益。 根据国务院或者省、自治区、直辖市人民政府对行政区划的勘定、调整或者征用土地的决定，省、自治区、直辖市人民政府确认土地、矿藏、水流、森林、山岭、草原、荒地、滩涂、海域等自然资源的所有权或者使用权的行政复议决定为最终裁决。也就是土地确权纠纷才是行政复议前置，而普通的土地侵权不需要行政前置。 土地纠纷按其争议的内容不同，可分为四类： （1）土地确权纠纷。此类纠纷是指因不同主体间就土地所有权或土地使用权的归属或界限等问题产生异议而引发的争议纠纷。 （2）土地侵权纠纷。此类纠纷是指因对他人已依法取得的土地所有权或使用权构成侵害，侵权人与被侵权人之间引发的争议纠纷。 （3）土地承包经营纠纷。此类纠纷是指因土地承包经营发生的纠纷。包括发包人与承包人之间、农村集体经济组织内部不同成员（承包户）之间，本农村集体经济组织内部成员与外村承包户之间因土地承包经营发生的各类纠纷。 （4）土地行政争议。此类纠纷是指因相对人对土地行政主管机关或人民政府作出的土地行政处罚等具体行政行为不服而引起的争议纠纷。
原则上依照《中华人民共和国土地法》调整，实际操作中，很多是依照当地的土地政策来解决，但是原则不能违背现行法律法规。土地政策通常是指政府、政党或单位为保护土地产权利益，实现土地的优化配置而制定的各项法规及规章制度。农民集体所有的土地，由县级人民政府登记造册，核发证书，确认所有权。
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