员工在患病住院期间是有工资的。 职工非因工患病需要出具相关的医院治疗证明，可向用人单位请病假。 根据《劳动部关于贯彻执行若干问题的意见》第59条规定，职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期间内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80％。 职工因工受伤符合工伤医疗待遇的，根据工伤保险条例第三十一条规定：职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。 停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过 12个月。工伤职工评定伤残等级后，停发原待遇，按照本章的有关规定享受伤残待遇。工伤职工在停工留薪期满后仍需治疗的，继续享受工伤医疗待遇。
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如果是工伤的话，则按照正常工资发放，平时发多少住院期间就发多少。如果是因病住院，则需要分两个阶段，第一个阶段就是住院6个月以内的，工龄不满2年的员工是发本人工资的60%，工龄满8年以上的，则发本人工资的100%。第二个阶段是住院时间超过6个月的，则工龄不满1年度的发40%，工龄超过3年的发60%。
工伤职工停止工作，治疗工伤期间，包括住院期间和出院后休养期间，称为停工留薪期，按遭受事故伤害前正常上班期间工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
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