投资者兴办两个或两个以上企业的，应分别向企业实际经营管理所在地主管税务机关预缴税款。年度终了后办理汇算清缴时，区别不同情况分别处理： (1)投资者兴办的企业全部是个人独资性质的，分别向各企业的实际经营管理所在地主管税务机关办理年度纳税申报，并依所有企业的经营所得总额确定适用税率，以本企业的经营所得为基础，计算应缴税款，办理汇算清缴; (2)投资者兴办的企业中有合伙性质的，投资者应向经常居住地主管税务机关申报纳税，办理汇算清缴，但经常居住地与其兴办企业的经营管理所在地不一致的，应选定其参与兴办的某一合伙企业的经营管理所在地为办理年度汇算清缴所在地，并在5年内不得变更。5年后需要变更的，须经原主管税务机关批准。 (3)投资者兴办两个或两个以上企业的，向企业实际经营管理所在地主管税务机关办理年度纳税申报时，应附注从其他企业取得的年度应纳税所得额;其中含有合伙企业的，应报送汇总从所有企业取得的所得情况的《合伙企业投资者个人所得税汇总申报表》，同时附送所有企业的年度会计决算报表和当年度已缴个人所得税纳税凭证。
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1、税务机关对个人独资企业个人所得税的征收方法有二种，一种是查账征收适用于会计核算比较齐全的，另一种是核定征收。具体采用哪种征收方法由主管税务机关确定。 2、采用查账征收方法的，以每一纳税年度的收入总额，减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额，然后根据个人所得税确定的税率表中对应的税率计算应纳税款。 3、采用核定征收方法的。依据国家税务总局关于印发《企业所得税核定征收办法》（试行）的通知》规定，采用按企业销售收入乘上应税所得率来计算应纳税所得额，然后，根据个人所得税确定的税率表中对应的税率计算应纳税款。
1.同一月份存在两处以上工资薪金收入，任职单位按照现行个人所得税规定，以本单位发放的工资薪金所得来计算预扣预缴个人所得税，无需考虑其他任职单位。对于员工个人来说，应当核实两处以上工资薪金收入，办理个人所得税自行申报（即年终汇算清缴）。2.个人两处以上取的工资收入，不可以由一方单位代理合并申报纳税，该事项属于个人自行申报事项。3.现行政策，对于居民个人从两处以上取得工资、薪金所得没有要求按月合并申报，但综合所得年收入额减除专项扣除的余额超过6万元的，需要办理汇算清缴，申请补税和退税。
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