土地使用税的缴纳与否，不是以纳税人使用土地为条件的，而是以是否具有使用权为条件。该私营企业应该按照实际占用的土地面积来缴纳土地使用税。《城镇土地使用税暂行条例》第二条规定："在城市、县城、建制镇、工矿区范围内使用土地的单位和个人为城土地使用税的纳税义务人。"同时该条例第三条规定："土地使用税以纳税人实际占用的土地面积为计税依据，依照规定税额计算征收。"国家税务总局《关于城镇土地使用税若干具体问题的解释和暂行规定》的通知第六条规定："纳税人实际占用的土地面积，是指由省、自治区、直辖市人民政府确定的单位组织测定的土地面积。尚未组织测量，但纳税人持有政府部门核发的土地使用证书的，以证书确认的土地面积为准；尚未核发土地使用证书的，应由纳税人据实申报土地面积。
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一般以企业实际占用的土地面积征收土地使用税，每平方米年税额最低0.6元、最高30元，在城市、县城、建制镇、工矿区范围内使用土地的单位和个人均应缴纳。
转让土地使用权营业税进行缴纳时：房产证满5年，面积在144以上的需要缴纳房产交易盈利部分的5.5%、在144以下的不需要缴纳；房产证未满五年的，面积在144以上的需要缴纳总房价的5.5%、在144以下的需要缴纳差价的5.5%。
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