自动离职用人单位应当结清工资，但劳动者应当赔偿损失。 自动离职，指劳动者根据用人单位和自身情况擅自离职，而强行解除与用人单位的劳动关系的一种行为。因辞职或要求解除合同未准，擅自离职或违约出走；未说明原因不辞而别；受优厚待遇诱惑擅自“跳槽”等均属自动离职。属于违法解除合同，按照《劳动合同法》第九十条和劳动部《关于实行劳动合同制度若干问题的通知》（劳部发〔1996〕354号）第18条规定，对用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。用人单位要求劳动者赔偿损失的，应当承担举证责任。 工资，是指用人单位依据劳动合同的规定，以各种形式支付给劳动者的工资报酬。劳动者付出了劳动，用人单位即应按照合同约定的标准支付报酬。根据劳动部《工资支付暂行规定》第九条规定，无论是解除合同是否合法，用人单位均应在解除合同之时一次性结清工资。 赔偿损失与结清工资是不同是不同的法律关系，二者应当分别计算，合并结算。
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根据我国法律规定，要求的是在解除劳动关系当天结清工资，也就是办理离职手续的当天应当结清工资。但是各地方又分别制定了工资支付条例，其中也对这部分做了规定，各地要求不尽相同。 由于很多企业会提出临时辞工对企业的现金流造成压力，所以劳动部门一般执行上会认为在一个工资发放周期内都不会被认定是拖欠。
司法实务中一般认可未经请假旷工超过三天时间视为自动离职。需要支付他工作期间的工资，即使自动离职也是为公司工作过，可根据上班时日做适当工资扣减，一般不能超过20%。
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