首先要确定公司是否存在违法解除的行为，然后员工在办理离职手续时是否做出过放弃诉讼等权利的表示，如果没有这类表示只是办理了离职手续时可以向劳动仲裁部门提起申诉要求公司赔偿的，但是应当在一年之内提出，否则就过了劳动仲裁的诉讼时效。 《劳动争议调解仲裁法》 第二十七条劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。 前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。 因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在本条第一款规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。 劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受本条第一款规定的仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
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申请劳动仲裁的流程如下： 一、提交申请书，当事人申请仲裁，应当提交书面仲裁申请书，并按照被申请人数提交副本。 二、仲裁委员会应当自收到仲裁申请之日起五日内作出受理或者不予受理的決定。仲裁委员会決定受理的，应当自作出決定之日起五日内将申诉书副本送达被申请人。決定不予受理的，应当说明理由。 三、开庭审理，仲裁庭应当于开庭的五日前，将开庭日期、地点书面通知双方当事人。无正当理由拒不到庭或者未经仲裁庭同意中途退庭的，对申请人按照诉自理，对被申请人可以做缺席裁决。 四、仲裁调解，仲裁庭处理劳动争议应当先行调解，在查明事实的基础上促使当事人双方自愿达成协议。调解达成协议的，仲裁庭应当根据协议内容制作调解书，调解书自送达之日起具有法律效力;调解未达成协议的中裁庭应当及时裁決。 五、仲裁裁決，仲裁庭裁劳动争议案件，应当自劳动裁委员会受理仲裁申请之日起四十五日内结束。案情复杂需要延期的，经准可以延期并书面通知当事人延长期限不超过十五日。
有劳动争议时员工可以申请劳动仲裁。《劳动法》第七十七条用人单位与劳动者发生劳动争议，当事人可以依法申请调解、仲裁、提起诉讼，也可以协商解决。调解原则适用于仲裁和诉讼程序。第七十九条劳动争议发生后，当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解;调解不成，当事人一方要求仲裁的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。当事人一方也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民法院提起诉讼。
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