对于在上下班途中发生的非本人主要原因的交通事故的，其中包含着两层法律关系，其一为工伤关系，其二为交通事故损害赔偿关系。您在上下班途中发生交通事故，对方全责，按照法律规定，构成工伤，是可以进行工伤申报、认定并且进行工伤索赔的。同时，对于交通事故，您也可以要求肇事者按照人身损害赔偿的规定，赔偿您相关的医疗费、护理费、误工费、住院伙食补助费（如果住院的话）、营养费等费用。两者不会存在影响。事实上，单位替您申报工伤的，对您的赔偿更为有利，因为按照实践中的操作，在申报完工伤之后，社保部门也会要求您先行处理交通事故，在交通事故处理完毕之后再处理工伤。对于工伤赔偿和交通事故的赔偿，如果存在重合的赔偿项目只赔偿一次，两者不重合的赔偿项目分开赔偿，是各自进行赔付的，所以您并不需要担心申报工伤对您不利，相反工伤中特有的赔偿项目只有申报工伤、成功认定工伤之后才会得到赔偿，这对您来说是有利的。
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发生交通事故，对方付全部责任的，可以根据自己的伤情要求对方支付各项医疗支出费用和因误工减少的输入，具体包括医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费，如果造成伤残的，还可以要求其支付赔偿金、被抚养人生活费、康复护理费等，导致死亡的，还可要求赔偿丧葬费、被抚养人生活费和死亡补偿费。
发生交通事故对方全责可以要求对其财物造成的损失予以赔偿，如果有人员受伤，还应当赔偿医药费、误工费、精神损失费等等费用。
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