第一、个人独资企业。不缴纳企业所得税，而是缴纳个人所得税。参见《企业所得税法》第一条第二款规定：个人独资企业、合伙企业不适用本法。而适用《个人所税法》，按《个人所得税法》第二条第二款“个体工商户生产、经营所得”项目征收个人所得税。 第二、税务机关对个人独资企业个人所得税的征收方法有二种，一种是查账征收适用于会计核算比较齐全的，另一种是核定征收。具体采用哪种征收方法由主管税务机关确定。 第三，只要企业有利润，不论采用哪种征收方法，也不论企业利润是否分配，都需要缴纳个人所得税。 第四、采用查账征收方法的，以每一纳税年度的收入总额，减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额，然后根据个人所得税确定的税率表中对应的税率计算应纳税款。 第五、采用核定征收方法的。依据国家税务总局关于印发《企业所得税核定征收办法》（试行）的通知》规定，采用按企业销售收入乘上应税所得率来计算应纳税所得额，然后，根据个人所得税确定的税率表中对应的税率计算应纳税款。
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投资主体不同。一人有限责任公司的投资主体可以是自然人，也可以是法人个人独资企业的投资主体只能是自然人。法律形式不同。 一人有限责任公司属于法定的民事主体，具有法人资格而个人独资企业属于非法人组织，不具有法人资格。一人有限责任公司的名称应该带有“有限责任公司”字样，而个人独资企业的名称则不能称公司。投资者责任承担不同。 一人有限责任公司的股东以认缴的出资额为限承担“有限责任”，仅在股东不能证明公司财产独立于股东个人财产的情况下对公司债务承担连带责任个人独资企业的投资人以其个人财产对企业债务承担无限责任，投资人在申请企业设立登记时明确以其家庭共有财产作为个人出资的，应当依法以家庭共有财产对企业债务承担无限责任。
个人独资企业没有企业所得税。投资人依法成立个人独资企业后，不需要向税务机关缴纳企业所得税，在取得收入后，只需要向税务机关缴纳个人所得税，个人独资企业的个人所得税不是按月缴纳的，而是按照一年的收入来计算的，投资人应当在一年结束后，按照法定时间去税务机关缴纳税款。
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