1、申请劳动仲裁期间，员工可以离职，劳动仲裁跟员工是否在职无关，只要仲裁有效的时限内提出劳动仲裁就可以的。 2、《劳动仲裁法》第二十七条劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。 前款规定的仲裁时效，因当事人一方向对方当事人主张权利，或者向有关部门请求权利救济，或者对方当事人同意履行义务而中断。从中断时起，仲裁时效期间重新计算。 因不可抗力或者有其他正当理由，当事人不能在本条第一款规定的仲裁时效期间申请仲裁的，仲裁时效中止。从中止时效的原因消除之日起，仲裁时效期间继续计算。 劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，劳动者申请仲裁不受本条第一款规定的仲裁时效期间的限制；但是，劳动关系终止的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。
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劳动者自动离职后也是可以申请劳动仲裁的。根据法律规定，当发生劳动争议时，劳动者是可以向劳动仲裁部门申请劳动仲裁的。劳动仲裁的时效期限是一年，在劳动者离职后的一年内都可以提起。
自动离职后是可以申请劳动仲裁的。一般情况下，劳动者在辞职一年之内都是可以向劳动局提出劳动仲裁的，因为劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。若是劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议的，应当自劳动关系终止之日起一年内提出。前提是自己要拿出当时和用人单位的劳动关系证明，这个可以包括员工的证人证言，以及自己的工资条，社会保险缴纳年限。
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