在专利权被侵权后，专利权人可以采取三种方式保护自己的专利权。 1、协商、谈判; 2、请求专利行政管理部门调解; 3、提起专利侵权诉讼。专利保护是指在专利权被授予后，未经专利权人的同意，不得对发明进行商业性制造、使用、许诺销售、销售或者进口，在专利权受到侵害后，专利权人通过协商、请求专利行政部门干预或诉讼的方法保护专利权的行为。
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有3种处理方法。如下：1、向人民法院起诉。前提是专利权过硬、侵权证据完整、侵权情况严重或被侵权损失严重；2、向专利管理机关提请行政调处。权利人掌握了初步证据，且侵权规模不大或损失还不严重；3、向侵权者发警告函。权利人掌握了初步证据，并且侵权规模不大或损失还不严重的。
1、协商与和解：专利权人和被控侵权人均可自行协商或在其他第三方的调解、斡旋下达成和解协议，解决纠纷。提出协商意向时一般可以向侵权方发送侵权警告函。这在我国专利法中并无规定，但在现实生活中却被经常使用，而且还常取到较好的作用。 2、行政裁决或协调：专利权人在侵权人侵权事实和证据充分确凿的情况下，可向专利局等有关行政部门举报，由其采取行政措施，对侵权人的侵权行为进行调查核实后作出行政处罚。在行政裁决过程中，有关专利行政部门基于有关当事人的申请，可对专利侵权的民事责任进行调解。 3、向法院起诉：专利权人在发现侵权人侵犯其专利权后，亦可径自向侵权行为地、被告所在地等相关人民法院提起民事诉讼，要求停止侵权行为赔偿经济损失等。同时有权申请对侵权人的侵权事实和证据进行诉讼保全，申请法院强制令，禁止侵权人继续侵权行为。为保证经济赔偿的切实执行，专利权人在起诉的同时，可向受理法院申请对侵权人的等额财产进行诉讼保全。
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