公司交的五险保障范围广，缴费高，相对来说，待遇也高一些。农村合作医疗保险缴费低，报销比例也相对低一些。两种保险不能重复享受，所以不需要一起交，在公司交五险的情况下，可以把农村合作医疗保险停缴。社会保险是一种为丧失劳动能力、暂时失去劳动岗位或因健康原因造成损失的人口提供收入或补偿的一种社会和经济制度。社会保险计划由政府举办，强制某一群体将其收入的一部分作为社会保险税（费）形成社会保险基金，在满足一定条件的情况下，被保险人可从基金获得固定的收入或损失的补偿，它是一种再分配制度，它的目标是保证物质及劳动力的再生产和社会的稳定。社会保险的主要项目包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险、生育保险。农村医疗保险，是我国社会保障的一部分，农村合作医疗制度是由政府支持、农民群众与农村经济组织共同筹资、在医疗上实行互助互济的一种具有医疗保险性质的农村健康保障制度。即农民每年交一定数额的合作医疗资金，集体与政府也可投入一部分，共同形成专项基金，农民就医时可按一定比例报销医药费。
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公司缴纳社保和个人缴纳社保的区别有四点，分别是：需要缴纳的险种不同；缴费比例不同；退休待遇有差别；养老保险领取不同。企业社保，参加基本养老保险的个人，达到法定退休年龄时累计缴费满十五年，按月领取基本养老保险。个人社保，个人缴纳的社保是覆盖城镇户籍非从业人员的养老保险制度。大部分城市是按年缴费的，不强制缴费属于自愿参保。
企业所需要交纳的五险是指社会保险中的五种保险，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险，其中，养老保险、医疗保险和失业保险这三种险是由企业和个人共同缴纳保费，工伤保险和生育保险完全由企业承担，个人不需要缴纳。因此企业应该按照社会保险法的相关规定，给企业员工交纳齐全标准的五险一金税率，从而保障劳动者的合法权益。
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