可以参考《最高人民法院关于人民法院审理离婚案件处理子女抚养问题的若干具体意见》如下规定确定： 1、两周岁以下的子女，一般随母方生活。母方有下列情形之一的，可随父方生活： （1）患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的； （2）有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的； （3）因其他原因，子女确无法随母方生活的。
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夫妻离婚有两个孩子，如果一方同意两个子女都归对方抚养时，法院会尊重双方达成的一致意见，由一个人抚养两个孩子。 如果双方在两个孩子抚养权问题上存在比较大争议时，法院一般会从缓和家庭矛盾和公平的角度出发，判决一方抚养一个孩子的概率会比较大。 当然法院在对于抚养权归属的判决上，也会遵循未成年子女的最大利益的原则，如果一方出现不适合抚养子女的情况，比如说有吸毒，赌博等恶习，患有久治不愈的艾滋病，梅毒等传染性疾病； 或者其他严重疾病的，或者一方曾经有家庭暴力，或者有虐待遗弃家庭成员行为的，同时一方长期不履行抚养义务等等这些情形，法院就有可能将两个孩子的抚养权都判归给一方。
离婚时，两个孩子的抚养权的归属问题，处理方法如下：可以由双方协商分割，不满两岁的孩子可以由母亲直接抚养。父母双方未就抚养问题达成协议的，由人民法院根据双方的具体情况，最有利于未成年子女的原则判决。
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