从事实验、保藏、携带、运输传染病菌种、毒种的人员，违反国务院卫生行政部门的有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉： （一）导致甲类和按甲类管理的传染病传播的； （二）导致乙类、丙类传染病流行、暴发的； （三）造成人员重伤或者死亡的； （四）严重影响正常的生产、生活秩序的； （五）其他造成严重后果的情形。
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一般情况下，出现以下情况之一的，公安机关可以立案追诉：1、致使甲类和按甲类管理的传染病传播的；2、致使乙类、丙类传染病流行、暴发；3、导致人员重伤或死亡；4、严重影响正常的生产、生活秩序；5、其他造成严重后果的情况。
传染病菌种毒种扩散罪的立案标准有：导致甲类传染病传播；导致乙类、丙类传染病流行发；造成重伤或死亡的；严重影响生产和生活秩序的；其他情形。传染病菌种毒种扩散罪是指从事实验、保存、携带、运输传染病菌种、毒种，违反有关规定，造成传染病菌种、毒种扩散的行为。
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