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医疗事故鉴定机构不会政府机构。鉴定的方式有医患双方协商共同向当地市级医学会发起申请，还有一种是被害人向法院起诉后，由法院委托相应机构进行医疗损害鉴定。这时候负责医疗损害鉴定的机构是随机抽取的，可以是医学会，也可以是具备相应的医疗损害鉴定资质的社会办司法鉴定机构。这两种方式中，鉴定机构都与政府无关。
医疗事故技术鉴定由医疗事故技术鉴定委员会进行鉴定，该委员会是政府的下设机构，属于卫生行政部门管理。当事人对首次医疗事故技术鉴定结论不服的，可以自收到首次鉴定结论之日起15日内向医疗机构所在地卫生行政部门提出再次鉴定的申请。
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