按以下文件规定处理：国家税务总局关于增值税一般纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票有关税务处理问题的通知国税发[2002]10号各省、自治区、直辖市和计划单列市国家税务局、地方税务局：为解决增值税一般纳税人（以下简称一般纳税人）丢失增值税专用发票产生的涉税问题，现将一般纳税人丢失增值税防伪税控系统开具的增值税专用发票的有关税务处理问题明确如下：一、一般纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票，如果该发票丢失前已通过防伪税控认证系统的认证，购货单位可凭销货单位出具的丢失发票的存根联复印件及销货方所在地主管税务机关出具的“增值税一般纳税人丢失防伪税控开具增值税专用发票已抄报税证明单”（样式附后），经购货单位主管税务机关审核批准后，作为增值税进项税额抵扣的合法凭证抵扣进项税额。一般纳税人丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票，如果该发票丢失前未通过防伪税控认证系统的认证，购货单位应凭销货单位出具的丢失发票的存根联复印件到主管税务机关进行认证，认证通过后可凭该发票复印件及销货方所在地主管税务机关出具的“增值税一般纳税人丢失防伪税控开具增值税专用发票已抄报税证明单”，经购货单位主管税务机关审核批准后，作为增值税进项税额抵扣的合法凭证抵扣进项税额。二、一般纳税人发生丢失防伪税控系统开具的增值税专用发票情况，必须及时向所在地主管税务机关报告，税务机关应对其报告的丢失发票是否已申报抵扣进行检查，对纳税人弄虚作假的行为，按照有关的法律法规进行处理。三、本通知自2001年7月1日起执行。原《国家税务总局关于加强增值税征收管理工作的通知》（国税发〔1995〕015号）第三条第二项的有关规定同时废止。附件：增值税一般纳税人丢失防伪税控开具增值税专用发票已抄报税证明单国家税务总局二○○二年二月一日
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普通的增值税发票一旦作废，是不需要再缴纳发票上的增值税税款的。企业开具增值税发票时，不可避免地会出现一些错误，这意味着发票需要作废后重新开具，而只要这张发票要在系统中作废，就不需要再缴纳发票上金额的税款了。
跨月作废的发票当月不需要交税。当月的发票退回来后，可以直接作废，不用纳税；过月的发票如果退回来，而且已经申报纳税，可以申请开红票冲减当月纳税额。开红票税务局有一套资料需要填写，同时经税务机关同意，具体手续可以咨询当地税务机关。如果是增值税普通发票，跨月不得作废。
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