医保卡个人账户的余额不会转到大病补助里，还是在自己的账户上，随时可以使用。城镇职工医疗保险单位和个人所缴纳的钱划分为两部分：一、个人账户（俗称医保卡）；二、统筹账户。每月都会从所缴费用当中按比例分配到这两个账户，换句话讲医保卡就是所缴保费中一部分的累计，可以供个人自由支配，支付门诊、到定点药店购买药品，以及支付住院费用当中自付额部分。同时，因病住院治疗需要统筹账户支付费用时，医保卡就是一个记账凭证（前提是有持续缴费）。一般医院的做法是入院时凭医保卡登记，所有的属于医保范围内的医疗费用直接由社保中心设在医院的结算中心直接与医院结算，自己只需支付自付额部分就行。当然、假如医保卡内有足够的余额（一般得累计很长时间），就用医保卡刷卡支付，如果不够，就由现金支付。
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办理大病补贴如下：医疗救助待遇的申请按属地管理原则，救助对象向户口所在地或街乡社保所提出书面申请；受理街乡社保所进行城乡特困人员医疗救助待遇的登记、申请受理等工作；审核乡镇民政部门对街乡社保所上报的申请材料进行审核。
1、携带本人身份证或户口簿等有效证件到所属的区或县医保中心相关部门办理补卡或换卡，医保中心的工作人员应该会当场办理完结； 2、参保人还可以携带有效身份证件到相关的服务点代为办理，在3个工作日内可以补办成功，参保人在规定的时间内领取即可; 3、参保人若不方便亲自办理，可通过委托人到相关区县医保中心或相关服务点申请补办，需要携带参保人和委托人本人的有效证件; 4、医疗卡补办时，医保中心或相关服务点会按规定收取一定工本费，并会开具相关收据。
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