各级软科学研究管理部门对申请归档和登记的软科学研究成果应进行认真细致的审查，合格者可在《软科学研究成果公报》上发布。凡正式公布的软科学研究成果，任何部门、单位或个人都有权提出异议，并在成果公报发布后三个月内将异议报送软科学研究管理部门，软科学研究管理部门应及时将异议转送项目归口管理部门和项目承担单位，由项目归口管理部门同项目承担单位共同处理，并在收到异议后两个月内，将处理结果报软科学研究管理部门。逾期不报又无正当理由者，则视为撤销该成果。如在三个月内未有人提出异议，或虽提出异议但经调查核实无任何问题的软科学研究成果，可发给《软科学研究成果登记证》，项目承担单位可凭此证前往科技成果登记部门办理有关登记手续。如确属剽窃或弄虚作假，将在公布范围内宣布撤销。情节严重的，将追究其法律责任。
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软件著作权侵权属于著作权纠纷，可以调解，也可以根据当事人达成的书面仲裁协议或者著作权合同中的仲裁条款，向仲裁机构申请仲裁。软件著作权侵权是指行为人本身并没有直接实施他人的软件著作权权能，但却帮助、诱导或放纵他人实施直接软件著作权侵权的行为。在软件著作权侵权中，须以行为人的主观过错为构成要件。
软件著作权受理后退回，显然是合法的行为，如果软件著作权申请时，提交的相关证明不清楚或者软件著作权涉及到侵权行为，审查机关应当退回。出版者、制作者应当对其出版、制作有合法授权承担举证责任，发行者、出租者应当对其发行或者出租的复制品有合法来源承担举证责任。
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